Game lấy bối cảnh vào năm 2179, 100 năm sau khi chiến tranh hạt nhân thế giới bùng nổ ở phần đầu. Suốt 4 thập kỷ sống dưới lòng đất, những người sống sót (Survivors) lại chui lên mặt đất tiếp tục chiến đấu chống lại những dị nhân đột biến (Evolved), tuy nhiên lần này họ gặp phải một kẻ thù mới xuất hiện với tên gọi Series 9. Robot Series 9 là những cỗ máy được cải tiến từ nguồn gốc cho các dự án nông nghiệp (chương trình bản gốc ban đầu của phe này đã bị hư hại bởi các bức xạ hạt nhân) và chế tạo vũ khí với mục đích tiêu diệt cả hai phe Evolved và Survivors, vì họ cho rằng con người phải chịu trách nhiệm vì đã phá hủy những cây trồng quý giá của họ.[1]